La medalla de la cofradía Matriz Andújar es de forma triangular y un tamaño aproximado de 6 cm alto x 4,5 cm de ancho. El cofrade Pedro Palenciano Olivares en el año 2004 rediseño la medalla en los cuatro modelos existentes, todos ellos claramente inspirados en los cetros de Fiscales que datan de principio del siglo XX.
Con los años la medalla de la Cofradía Matriz ha sufrido pequeñas evoluciones.
En la parte central de la medalla podemos ver la Imagen de María Santísima de la Cabeza, con corona real labrada de seis imperiales. La Imagen de Nuestra Señora sostiene al Niño Dios sobre su brazo izquierdo, también coronado, portando mano izquierda una esfera dorada, en representación del Mundo.
La cara de la Virgen se nos muestra elevando la mirada con una leve inclinación de la cabeza a su derecha como la imagen antigua que desapareció. El rostro adornado por un rostrillo repujado que deja ver suavemente los cabellos peinados estando decorado con cuatro joyas preciosas, configuradas en cruz.
Su cuerpo está cubierto por manto largo que la cubre, cayendo en suaves pliegues y dejando ver antiguos bordados. La saya, de cuerpo entero, deja ver la silueta del Niño, presentando una abertura, también rematada con encaje, por donde la Virgen Santísima asoma su mano derecha con la que entrega una «fruta» a su Divino Hijo. En la parte inferior podemos ver una media luna apocalíptica a sus pies y bajo esta media luna un pedregal de la sierra.
A la izquierda podemos ver la figura del pastor de perfil arrodillado y con las manos entrelazadas, mirando hacia la Imagen, con la cabeza ligeramente levantada. A su lado aparece el bastón sobre las piedras y dos ovejas, una pastando y otra acostada. Sobre el pedregal y a la izquierda de la Virgen se levanta un arbolito enramado y con hojas, que se prolonga hasta la altura del cuerpo del Niño. Pende de una de sus ramas una campanilla y aparece posado en él un pajarito que mira hacia la Virgen.
Como fondo a la izquierda, recortadas en el horizonte de la sierra, encontramos dos tiendas para refugio de Cofradías, y tras ellas se levanta el cerro del Cabeza con veredas abruptas, coronado por el Santuario, cuya fábrica exterior presenta una sola nave rematada por espadaña de un solo vano, coronada por una cruz latina.
El bisel tiene forma de filigrana, compuesta por diez rocallas internas en diez roleos, cuatro en cada costado y dos en su base. En su parte superior, la orla está rematada por una asimétrica hoja de acanto, tras la que queda fijada la anilla para enganchar el cordón. En el centro de ambos lateral dos motivos vegetales de acanto con menor tamaño. En sus dos esquinas inferiores encontramos dos conchas peregrinas y en el centro de la franja inferior, un simétrico ornamento que pone broche a todo el contorno de la medalla.
En el reverso, aparece el escudo de la Real Cofradía Matriz, centrado y algo desplazado hacia la mitad superior de la medalla.
Toda esta figuración se basa en las primeras medallas que muestran los iconos que hasta hoy nos han llegado representados.
